第一：冷库空气杀菌消毒
生产车间的微生物污染是影响产品质量的极重要因素，臭氧不但可有效地杀灭它们，并可有效去除车间异味。
能使生产车间的空气、地面、操作台、器具等物体表面细菌指标达标合格。
第二：更衣室和工作服消毒
生产车间的大部分细菌，都能通过加工人员的工作服带入生产车间，严重时会导致大面积传播，应引起足够重视。
食品加工企业大多数采用紫外线照射消毒，因紫外线照射的天然缺陷，消毒效果较差，而臭氧气体可渗透服装各个部位，故利用臭氧对工作服进行消毒是高效、简单的方法。
第三：生产用水的杀菌净化
臭氧在水中对细菌、病毒、微生物等杀灭率更高、速度更快，对水中有机化合物等污染物质去除彻底，而又不产生二次污染。
传统的氯制剂消毒后会产生氯仿、二氯乙烷、四氯化碳等氯化有机物，这些物质具有危害。
而臭氧消毒处理后不产生二次污染化合物，且臭氧对细菌的杀灭率比氯制剂更高，杀灭速度大约是氯制剂的300～600倍。
特别在预冷消毒中，克服了次氯酸钠消毒后氯残留的缺点，可以高效、经济、简便的杀灭细菌。
第四：制备高浓度的臭氧水做为新型消毒剂
把高浓度的臭氧溶解于水中。制成的臭氧水具有极强的广谱杀菌效果，同时对各种农药、有机毒物、重金属离子都有极强的降解作用。
高浓度的臭氧水在完成杀菌消毒及降解其它有害物质时，臭氧重新变成氧气，在水中不留下残留物，无二次污染和任何副作用
第五：食品冷库和保鲜冷库消毒
冷库的生物污染源主要是霉菌，它们对化学消毒剂有很强的耐受力，而且在低温条件下存活。
实验证明：使用浓度为6～12PPM的臭氧连续3～4小时消毒，可以将包括抵抗力极强的未萌动孢子杀死。
停机后封库24小时以上，细菌杀灭率达90%左右，霉菌杀灭率可达80%左右。
在食品保鲜中应用臭氧可以起到杀菌防霉与减缓新陈代谢的作用，同冷藏、空调、包装协同使用，更能提高食品的保鲜效果。
第六：包材、容器的消毒
包装物、塑料瓶、玻璃瓶等可以使用高浓度臭氧水进行浸泡消毒，可以达到非常好的效果。
